《表2 AC-PCR引物序列》

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《基于2b-RAD技术的糯玉米品种‘沪玉糯3号’特异SNP分子标记开发》


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引物序列中加粗的核苷酸为SNP位点。

利用Tassel 5.0软件(Bradbury等2007)分析‘沪玉糯3号’、‘申W22’和‘申W48’中SNP位点杂合率及样品间SNP位点差异,筛选出‘申W22’和‘申W48’间的多态性SNP位点,并根据其在玉米‘B73’参考基因组(ZmB73_RefGen_V4)上的侧翼序列设计等位竞争PCR(allele-competitive PCR,AC-PCR)引物(郑艳萍等2006)(表2),验证‘沪玉糯3号’及其亲本的基因型。