《表2 Ensembl中的鱼类数据库》

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《鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库的调研与分析》


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注:根据数据处理时Ensembl数据库的信息,发现其中包含58种鱼类数据库.

调研Ensembl数据库发现,该数据库包含脂鲤目(Characiformes)、鲱形目(Clupeiformes)、鲤形目(Cypriniformes)、鳉形目(Cyprinodontiformes)、鳕形目(Gadiformes)、刺鱼目(Gasterosteiformes)、电鳗目(Gymnotiformes)、雀鳝目(Lepidosteiformes)、盲鳗目(Myxiniformes)、骨舌鱼目(Osteoglossiformes)、鲈形目(Perciformes)、鲽形目(Pleuronectiformes)、多鳍鱼目(Polypteriformes)、鲑形目(Salmoniformes)、鲇形目(Siluriformes)、合鳃鱼目(Synbgranchiformes)和鲀形目(Tetraodontiformes)共17个目58种鱼类的基因组数据(表2)。其中,鱼类种类最多的是鲈形目有23种,其次是鳉形目,有12种。脂鲤目、鳕形目、电鳗目、盲鳗目、多鳍鱼目、合鳃鱼目、鲇形目及雀鳝目都只有1种鱼类。研究表明,从无颌脊椎动物向四足动物演化的进程中,出现过4次全基因组倍增事件,斑点雀鳝(Lepisosteus oculatus)是基因组倍增事件的分界点[28],作为相对原始的1种鱼,其基因组没有出现鱼类特有的基因组倍增事件。对斑点雀鳝基因组信息的挖掘与分析,可为鱼类关键代谢疾病相关基因的结构和功能演化提供数据支持。