《表2 MITEs在鱼类基因组中的分布》

《表2 MITEs在鱼类基因组中的分布》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《33种鱼类微型反向重复转座元件鉴定》


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鱼类基因组中的MITEs转座子具有较高的丰度,为了保证结果的准确性,仅选取有完整TIR的MITEs全长拷贝进行插入位置分析。结果显示(表2),鱼类基因组的MITEs全长拷贝插入到基因内部的数量十分丰富(计算插入时,以转座子所处位置为准,较长的转座子可能出现重复计数的现象,对结果无影响),例如斑马鱼插入到基因的有12885个。其中矛尾鱼、斑点雀鳝、象鼻鱼、大西洋鲱、斑马鱼、犀角金线鲃、墨西哥丽脂鲤、斑点叉尾鮰、大西洋鲑鱼、红鳍东方鲀、黄鳝、半滑舌鳎、贝氏隆头鱼、大黄鱼、罗非鱼、布氏新亮丽鲷、斑马宫丽鱼、红丽鱼、伯氏朴丽鱼、小丑鱼、花斑剑尾鱼、弗氏假鳃鳉和日本青鳉基因组中的MITEs都有插入到外显子的情况。对这部分基因进行注释,发现象鼻鱼、斑马鱼、墨西哥丽脂鲤、弗氏假鳃鳉、黄鳝、大黄鱼、小丑鱼、罗非鱼的MITEs都插入到能够编码具有锌指结构的蛋白(Zinc finger)的序列中,这些序列编码的蛋白大多与基因表达相关;墨西哥丽脂鲤有一条MITEs插入到能编码视蛋白对应的序列中;斑点雀鳝的有一条MITEs插入到编码脂肪包被蛋白(与肥胖相关)的序列中等等。但后续还需要更详细的分析和实验验证,才能明确MITEs是否对基因表达有影响。