《表1 分析所用物种及其GenBank序列号》
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《秀丽白虾线粒体16S rRNA基因序列及长臂虾亚科系统进化初步分析》
注:物种及其对应编号,下同。
共成功测序54个秀丽白虾样品。另从GenBank下载14种虾(长臂虾亚科12种,隐虾亚科和鼓虾科各1种)的16S rRNA基因片段序列作为对比分析数据,分析所用物种信息见表1。所得序列通过DNA Star、Clustal X 1.81等软件进行序列拼接、比对。单倍型分析采用DnaSP 5.10软件完成。碱基组成、变异位点、遗传距离及系统进化分析由软件MEGA 3.1完成,其中遗传距离采用Kimura双参数模型,进化树以细指岩虾(Periclimenes digitalis)(长臂虾科隐虾亚科岩虾属)和细足鼓虾(Alpheus gracilipes)(长臂虾总科鼓虾科钩虾属)为外类群,用MEGA 3.1软件中的NJ(Neighbor Joining)和ME(Minimum Evolution)2种方法构建,各分支的置信度由Bootstrap 1000循环检验。
图表编号 | XD00180836200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.15 |
作者 | 张敏莹、徐东坡、周彦锋、方弟安、刘凯、潘泽钰 |
绘制单位 | 农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、南京农业大学渔业学院 |
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