《表1 分析所用物种及其GenBank序列号》

《表1 分析所用物种及其GenBank序列号》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《秀丽白虾线粒体16S rRNA基因序列及长臂虾亚科系统进化初步分析》


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注:物种及其对应编号,下同。

共成功测序54个秀丽白虾样品。另从GenBank下载14种虾(长臂虾亚科12种,隐虾亚科和鼓虾科各1种)的16S rRNA基因片段序列作为对比分析数据,分析所用物种信息见表1。所得序列通过DNA Star、Clustal X 1.81等软件进行序列拼接、比对。单倍型分析采用DnaSP 5.10软件完成。碱基组成、变异位点、遗传距离及系统进化分析由软件MEGA 3.1完成,其中遗传距离采用Kimura双参数模型,进化树以细指岩虾(Periclimenes digitalis)(长臂虾科隐虾亚科岩虾属)和细足鼓虾(Alpheus gracilipes)(长臂虾总科鼓虾科钩虾属)为外类群,用MEGA 3.1软件中的NJ(Neighbor Joining)和ME(Minimum Evolution)2种方法构建,各分支的置信度由Bootstrap 1000循环检验。