《表2 大刺鳅GH氨基酸序列及各参照物种GH氨基酸序列的GenBank登录号》

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《大刺鳅生长激素基因克隆与表达分析》


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大刺鳅GH氨基酸序列与GenBank上其他19种物种的GH氨基酸序列进行比对分析,结果发现在所有物种中均存在4个保守的半胱氨酸(Cys)残基,且近C-端区域内的序列高度保守(图2)。利用Multiple Sequence Alignment by CLUSTALW(https://www.genome.jp/tools-bin/clustalw)对比GenBank已公布物种(表2)的GH氨基酸序列,发现大刺鳅GH氨基酸序列与斑鳜(Siniperca scherzeri)、花鲈(Lateolabrax maculatus)和黄鳝(M.albus)的同源性较高,对应的同源性分别为95.59%、95.07%和92.16%;在基于GH氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树(图3)中,大刺鳅与同属于合鳃目的黄鳝聚为一支,亲缘关系最近,而与陆生动物的同源性仅为25.49%~33.33%,即鱼类与哺乳动物形成独立的进化分支,与形态学系统发育进化树相吻合。