《表1 Alpha多样性指数统计》

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《基于高通量测序分析不同年份闽南腌制萝卜干中细菌多样性》


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5个样本质控后共产生247 538条有效序列,平均序列长度为416 bp,使用97%相似度的OTU,总共聚成480个OTU,利用Mothur1.30.1做Alpha多样性分析,结果见表1。由表1可以看出,LL20样本的Chao指数最大,说明LL20样本的细菌丰富度最高。细菌群落的多样性可以用Shannon指数以及Simpson指数衡量[19]。