《表2 PMMo V沈阳9个分离物之间的CP同源性1) Table 2 Sequence identities based on the cp of 9 Shenyang isolates》
1) nt:核苷酸;aa:氨基酸.
PMMo V 9个沈阳分离物cp基因的核苷酸序列同源性和CP蛋白的氨基酸序列同源性均为98.3%~100.0%(表2),可见它们属同一个分离物,后续选取分离物Pepsy进行同源性分析.基于cp基因将PMMo V Pepsy分离物与Gen Bank中已报道的PMMo V各个分离物进行比对,核苷酸同源性为93.7%~99.8%,氨基酸同源性为96.8%~100.0%,其中与PMMo V北京分离物(PMMo V-[CN:BJ],AY859497)的同源性最高,均达100%(表1).系统进化树表明,沈阳PMMo V 9个分离物与P1,2型PMMo V聚在一个大分支上,而P1,2,3型和P1,2,3,4型聚在另一个分支上,TMV-[CN:FJ](AF395127)作为外群单独聚在一个分支上(图3).
图表编号 | XD0018058900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.01.18 |
作者 | 杨彩霞、付晶晶、韩彤、廖一鸣、李莉、于美春 |
绘制单位 | 沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室、沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室、沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室、沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室、沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室、沈阳大学生命科学与工程学院、辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室 |
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