《表3 W-5与Gen Bank中登录菌株r DNA序列同源性比较Table 3 Sequence comparison between W-5 and those loaded from Gen B

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《黑龙江省洋葱主产区鳞茎致腐病原分离鉴定》


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为进一步确定致病菌种属关系，以2种疑似菌株基因组DNA为模板，利用细菌16S r DNA通用引物（27F，1492R）PCR扩增，2种菌均扩增目的条带，其大小与预期一致（见图4）。将胶回收后PCR产物送华大基因公司测序，测序结果显示，菌株W-5和Z-7扩增产物均为1 338 bp。比对分析所得序列与Gen Bank中核酸序列，Blast对比结果显示（见表3），W-5菌株与Gen Bank中登记号为LT629801.1、KT695839.1、KT695836.1、AB819473.1、KF054779.1和JX994152.1等菌株同源性较高，达99.9%以上，可确定该菌株为罗氏假单胞菌（Pseudomonas rhodesiae）；Z-7菌株与Gen Bank中登记号为CP019670.1、CP019668.1、CP017238.1、CP019669.1、CP000458.1和CP000378.1等菌株同源性达99.6%以上（见表4），确定该菌株为洋葱伯克霍尔德菌（Burkholderia cepacia）。

图表编号XD0014047800    严禁用于非法目的
绘制时间2018.02.25
作者王勇、高璐瑶、张郑、袁巧玲、陈典
绘制单位东北农业大学园艺园林学院、农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
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