《表3 Alpha多样性指数表》

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《利用高通量测序技术探究肠球菌属在Ⅲ期与Ⅳ期结肠癌患者间的丰度差异》


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Alpha多样性分析是反映样本物种组成丰富度和多样性的重要指标。对两组样本进行基于OTU水平的Alpha多样性差异分析,可以有效反映两组在物种组成丰富度和多样性层面的差异。我们选取了sobs指数、chao指数、ace指数来反映物种丰富度,采用辛普森(simpson)指数、香农(shannon)指数来反映物种多样性。指数组间差异性检验提示,Ⅲ期组与Ⅳ期组在物种多样性和丰富度上差异有统计学意义(P<0.05)(见表3)。此外,我们在属水平进行了群落组成分析,选取丰度前15的菌属绘制了Heatmap图(见图2)。群落组成分析结果提示,两组在菌属水平的群落组成上有着明显不同。