《表2 代谢组学中常见数据库特点》

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《代谢组学技术发展及其在农业动植物研究中的应用》

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代谢物定性的准确性不仅取决于质谱仪的检测分辨能力，对应的代谢物数据库也至关重要。随着代谢组学研究的发展，代谢物数据库的构建逐渐完善。GC-MS检测到的代谢物通常参考NIST和FiehnLib数据库进行代谢物定性；LC-MS通常使用METLIN、HMBD数据库及部分自建库；脂质物质的种类繁多、结构特殊，通常使用脂质组专用的数据库LipidSearch、LMSD等进行比对确认。通过多元统计分析得到关注的代谢物或差异代谢物后往往还需要进行通路富集分析，揭示影响复杂生物过程的多种因素，通常使用KEGG和Reactome等数据库进行分析。随着代谢组学逐步发展，将多种数据库资源整合已经成为趋势，进一步提高数据资源利用率，其中跨库原始数据检索平台-MetabolomeXchange（http://www.metabolomexchange.org/site）于2015年由多家机构共同建立，为数据库资源的整合和扩展提供快捷途径。代谢组学中常用数据库见表2。