《表1 染色体标记信息及遗传距离信息》

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《利用重组自交系高密度遗传图谱定位水稻芽期耐冷QTL》


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对测序的数据进行分析,获得高质量的SNP 701,310个。对获得SNP进行bin转换,经过严格筛选,最终获得均匀分布在12条染色体上2578个bin标记,平均每条染色体包含214.8个bin标记。其中,标记最少的是8号染色体,有159个bin标记,标记最多的是1号染色体,有303个bin标记(表1)。进一步利用这些bin标记分析124个家系构建了高密度遗传图谱,该图谱总距离为1762.8 Mb(图1)。其中,2个相邻标记之间的平均距离为0.70 Mb,12号染色体的平均距离最小,为0.58 Mb,8号染色体上的平均距离最大,为0.92 Mb。