《表2 菌株HN1-26和XN3-1的获得性耐药基因预测结果》

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《两株bla_(NDM-5)基因介导的碳青霉烯耐药禽源大肠杆菌ST10和ST354耐药性》

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通过S1-PFGE和Southern blot发现，菌株HN1-26和XN3-1存在相同大小的携带blaNDM-5的质粒（图3），将其命名为p HNNDM-yll和p XNTBNDM。基于全基因组测序的组装结果，获得的这两个质粒的全序列大小为46 161 bp，且序列完全一致。利用ResFinder数据库对测序结果进行了分析，在菌株HN1-26的基因组中预测到10个获得性耐药基因：β-内酰胺类blaNDM-5、blaTEM-1B；氨基糖苷类aph（3′′）-Ib、aph（3′）-Ia、aph（6）-Id；喹诺酮类oqxB；甲氧嘧啶类dfrA17；苯丙醇类catA1；磺胺类sul2；四环素类tet（B）；在菌株XN3-1的基因组中预测到16个获得性耐药基因：β-内酰胺类blaNDM-5、blaTEM-1B；氨基糖苷类aadA2、aph（6）-Id、aadA22、aph（3′）-Ia；喹诺酮类qnrS1；甲氧嘧啶类dfrA12、dfrA14；大环内酯类mph（A）、mdf（A）、lnu（F）；苯丙醇类catA1、floR；磺胺类sul3；四环素类tet（A）（表2）。虽然两种菌株对一些抗生素耐药表型相同，但是耐药基因却不同，例如菌株HN1-26对四环素的耐药基因是tet（B），而XN3-1是tet（A）。此外，在HN1-26中预测到了parE（p.I355T）突变、gyr A（p.S83L、p.D87N）双突变和parC（p.S80I、p.E84G）双突变，在XN3-1中只预测到了gyrA（p.S83L）突变，并且这些突变均介导了两株菌对喹诺酮类药物萘啶酸和环丙沙星的抗性。