《表2 菌株EFCF053和EFCF056的耐药谱与获得性耐药基因》

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《两株分离自鸡粪便费格森埃希菌的耐药性》

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注：R：耐药；S：敏感.

对获得性耐药基因进行了预测，结果显示2株菌的耐药表型都可以通过获得性耐药基因得到解释（表2）。但是相同耐药表型的菌株耐药基因可能不同，例如对复方新诺明耐药的菌株EFCF053的耐药基因是dfrA14，而EFCF056为dfrA12；对磺胺异噁唑耐药的菌株EFCF053的耐药基因是sul2、sul3，而在EFCF056中是sul1、sul2；介导菌株EFCF053对氨苄西林耐药的是blaTEM-1A，而EFCF056中则是blaTEM-1B。多个基因共同介导耐药，具体耐药贡献不明确，例如菌株EFCF056对喹诺酮类耐药的基因有qnrS2、aac（6'）-Ib-cr、oqxA、oqxB共4个。通过2株菌的耐药表型比较可以推测blaCTX-M-65、blaOXA-1、blaCTX-M-55基因介导了头孢他啶和头孢噻呋的耐药，基因rmtB、aadA2、aac（6'）-Ib-cr更有可能参与大观霉素的耐药。预测到的fosA3、mph（A）、ARR-3耐药基因，分别可能介导菌株EFCF056对磷霉素、大环内脂类和利福霉素的耐药，但是缺少药敏实验验证。另外重要的是，在菌株EFCF056中发现了耐药基因mcr-1，造成了该菌对粘菌素的耐药；两株菌都含有编码超广谱β-内酰胺酶（ESBL）的基因，菌株EFCF053中的blaTEM-1A和EFCF056中的blaCTX-M-65、blaOXA-1、blaTEM-1B和blaCTX-M-55。最后对2株菌的耐药质粒进行了预测，发现多个复制子类型，菌株EFCF053中有Inc FIB、Inc FII、Inc HI2、Inc HI2A、Inc X1复制子；而EFCF056中除了含有上述所有复制子外，还预测到Inc Q1和p0111复制类型，这意味着2株菌都含有多个质粒。通过S1-PFGE可以进一步证明，菌株EFCF053和EFCF056中大于40 kb的质粒分别为4个和5个，且带型具有很大差异（图1）。