《表1 青蛤27对微卫星引物序列及其参数》

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《基于转录组数据的青蛤微卫星标记开发与验证》


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利用Primer3软件,设计了81对SSR引物,以8个灵昆青蛤的基因组DNA为模板,进行PCR扩增,退火温度上下波动5℃左右为梯度,对81对EST-SSR引物进行了初步筛选。研究发现扩增出稳定的可重复条带的引物为48对,占引物总数的59.26%;通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合EB染色检测,81对SSR引物中有27对表现出个体多态性,占引物总数的33.33%。多态性引物占有效引物的比例为56.25%。27对多态性引物中,11个双核苷酸重复,4个三核苷酸重复,3个四核苷酸重复,2个五核苷酸重复,1个六核苷酸重复,5个混合型重复。27对引物序列等详细信息如表1所示。