《表3 Ipomoea cordatotriloba基因组特征统计情况》

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《甘薯近缘种Ipomoea cordatotriloba基因组大小测定及高通量调查测序》


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本研究选用K-mer=17进行分析,其频率分布图(图3)显示,I.cordatotriloba的期望深度即图中的主峰,在38附近,且主峰的2倍处有凸起,表明样品有一定重复率,经计算I.cordatotriloba的重复序列比率为57.93%,并根据公式(4)得到杂合率为0.40%。由表3可知,I.cordatotriloba的K-mer数量为18 867 813 720,通过公式(3)计算得出I.cordatotriloba基因组大小为571.75 Mb,经修正后为560.70 Mb。