《表3 2016年wsv006基因变异情况统计》

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《2016—2017年我国部分地区白斑综合征病毒wsv006的变异分析》

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在扩增出wsv006的25个样本中，除2017年河北黄骅的3个样本氨基酸未发生变异外，其余22个样本的wsv006编码氨基酸变异明显。氨基酸的变异类型为单个氨基酸替换与缺失、多个氨基酸插入和终止翻译（表3、4）。在不同年份和地区的样本中插入位点、插入序列数目和排列顺序存在差异，插入的主要是脯氨酸（P）和苏氨酸（T），插入位点处于这2种氨基酸的交叉重复区域，该区域存在2个PTPTPTPP重复单元，经过DNAMAN比对结果显示插入位点有3个，即第1个单元之前、2个单元之间和第2个单元之后，由于插入序列为PT循环或PT循环与PP交叉，这与重复单元序列极为相似，因此不能确定具体的插入位点，仅能确定在第151~166位。除去提前终止和未变异的样本，由于插入氨基酸导致wsv006肽链的长度由原来295 aa分别变为301、303、305和307 aa，其中301 aa长度出现在2016年河北唐山和2017年山东滨州的样本中，插入序列为PTPTPT（图1）；303 aa长度出现在2016年河北黄骅和2017年广东湛江的3个样本中，插入序列为PTPTPTPT（图2）；305 aa长度在2016年河北唐山和2017年福建霞美镇、上海的样本中出现，共7个样本，插入序列为PTPTPTPTPT；福建霞美镇的FX-8样本长度为307 aa，插入序列为PTPTPTPTPTPT（图3）。2016年山东日照和河北沧州、唐山的样本以及2017年山东东营的样本中都出现了在第184位提前终止翻译的现象（图4），这主要是由于核苷酸序列的第541位插入了GAGG，导致了移码突变，在转录过程中第543~545位形成了终止密码子UGA。除去终止翻译的样本，其余的16个样本均在第172位出现氨基酸的替换，T→I。