《表1 16S rRNA序列分析在昆虫共生菌多样性分析中的应用举例》

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《昆虫共生菌对宿主功能研究的方法体系》

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共生菌多样性分析常用的方法有2种：（1）分子标记分析法。对细菌的16S rRNA的可变区进行分析（表1），通过比对细菌特征数据库进行较准确和全面的分类；（2）体外培养鉴定法。解剖带菌组织获得菌液，分离培养得到纯化菌株。根据菌株的各种特性或分析菌株的16S rRNA序列确定种类。然而，由于共生菌生长所需的条件复杂，绝大多数共生菌目前难以进行人工培养（梅承等，2018），如在舞毒蛾Lymantria dispar幼虫中肠，使用胰蛋白酶大豆琼脂培养基（TSA）分离出15种细菌，利用末端限制性片段长度多态性（T-RFLP）分析16S rRNA序列检测出23种细菌（Broderick et al.，2004），而利用16S rRNA高通量测序分析出203个分类单元（Martemyanov et al.，2016）。因此，尽管培养法能将共生菌明确到种的分类阶元，但不能准确反映样品中共生菌的组成情况。