《表2 养殖大鲵肠道细菌免培养16S rRNA序列多样性对比》

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《养殖大鲵肠道细菌多样性》

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将测序的105条有效序列，整理后提交GenBank数据库中，取除嵌合体序列获得100个养殖大鲵免培养肠道细菌登录号:KU872390-KU872489。由表2可知，进行BLAST检索后，阳性克隆单元序列（operational taxonomic units，OTU）如下:变形菌门（Proteobacteria）75株，占总克隆数的71.43%，其中埃希氏菌属（Escherichia sp.）29单元，占总数的27.62%，志贺氏菌属（Shigella sp.）30单元，占总数的28.57%，沙雷氏菌属（Serratia）3单元，占总数的2.86%，耶尔辛氏菌属（Yersinia sp.）2单元，占总数的1.90%，食碱菌属（Alcanivorax sp.）7单元，占总数的6.67%，沙门氏菌属（Salmonella sp.）1单元，占总数的0.10%，哈夫尼菌属（Hafnia sp.）1单元，占总数的0.10%，希万氏菌属（Shewanella sp.）1单元，占总数的0.10%，布丘氏菌属（Buttiauxella sp.）1单元，占总数的0.10%；放线菌门（Actinobacteria）21株，占总克隆数的20.01%，其中短杆菌属（Brevibacterium sp.）19单元，占总数的18.10%，戈登氏杆菌属（Gordonibacter sp.）1单元，占总数的0.10%，红蝽杆菌属（Coriobacterium sp.）1单元，占总数的0.10%；厚壁菌门（Firmicutes）8株，占总克隆数的7.62%，其中芽孢杆菌属（Bacillus sp.）7单元，占总数的6.67%，葡萄球菌属（Staphylococcus sp.）1单元，占总数的0.10%；拟杆菌门（Bacteroidetes）占总克隆数的0.95%，其中理研菌属（Rikenella sp.）1单元，占总数的0.10%。