《表1 肽键特征集：基于多头注意力机制和残差神经网络的肽谱匹配打分算法》

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《基于多头注意力机制和残差神经网络的肽谱匹配打分算法》

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在自然语言处理（Natural Language Processing，NLP）中，对单个字或词进行编码是十分重要的，因此逐渐发展出了WordEmbedding[19-20]这样的特征编码方式。而本文所涉及的肽碎裂事件中肽键可以被看作一个基本单位，即可以借鉴自然语言处理中的编码方式对其进行特征编码，通过类似onehot类型的编码将氨基酸残基表示成22维的向量。在肽键碎裂过程中，肽键左右相邻的氨基酸种类及肽序列中碱性氨基酸和肽序列所带电荷的数量对肽键的碎裂起着至关重要的作用。本文综合考虑了以上因素，最终形成了以下105维的特征集（以某一肽键为例），具体特征集如表1所示。