《表2 认知基因集与对比基因集拓扑参数对比》

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《认知相关基因的生化通路与蛋白质互作网络分析》

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通过分析蛋白质互作网络中节点和边的拓扑性质，可以更好地理解生物网络的内在机制。为了更好地描述分析认知相关基因以及几个对照基因集的网络拓扑性质，选取节点度和介数这2个比较重要的网络拓扑结构参数。对于网络来说，节点的度是指节点与网络中其他节点直接连接的数量，而度比较高的节点通常对生物网络的整体结构或功能比较重要[23-24]。而介数一般用来衡量节点在保持网络紧密连接中的作用，介数越大，此节点对于其他节点间彼此的连接越重要。认知相关基因集中的126基因有119个可以映射到人类PPIN网络上，其平均节点度为47.6；3803个HK基因中有3595个可以映射到PPIN网络上，其平均节点度为50.2；1485个ES基因中的1428个可以映射到PPIN网络上，平均节点度为49.4，1278个TF基因中能个映射到PPIN网络上的有1193个，平均节点度为38.4；背景基因的平均节点度为28.5。Wilcoxon秩和检验的结果表明（表2），在PPIN中，认知相关基因的平均节点度和介数显著高于背景基因，但是与ES，HK以及TF基因集相比没有显著差异。