《表3 蛋白物质LC-MS/MS定性分析结果》

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《一株甲基营养型芽孢杆菌抑菌活性物质鉴定》


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注:OS为物种拉丁名,GN为基因名称,PE为蛋白存在证据级别(PE=1:experimental evidence at protein level,PE=2:experimental evidence at tranlevel,PE=3:protein inferred from homology,PE=4:protein predicted,PE=5:protein uncertain),SV为蛋白质序列版本。

每个蛋白经酶解产生长短不一的肽段后应用LC-MS/MS对其进行鉴定,根据每个时间点质谱信号强度最高的母离子绘制得到TIC图(见图4)。基于信号最强的肽段的强度值绘制得到Base Peak图(见图5)。基于UniProt-Bacillus subtilis序列库进行蛋白样品的序列库搜索,比对获得共计750个肽段,520个蛋白质。抑菌活性相关蛋白信息见表3,鉴定到3种表面活性素合成酶亚基(基因名称分别为srfAA、srfAB、srfAC)、聚酮合成酶(基因名称分别为pksN、pksL)、鞭毛钩相关蛋白(基因名称分别为fliD、flgK)等。