《表1 LMP2和LMP7基因的引物序列》
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《云南省汉族人群LMP基因多态性与结核病易感性的关联性研究》
设计SNP位点特异性的扩增引物和延伸引物,扩增引物和延伸引物信息见表1。扩增体系为模板DNA(25 ng)、上下游引物(10μmol/L)各2μL、TSINGKE金牌Mix45μL,总反应体系50μL。PCR扩增反应条件:98℃预变性2 min,98℃变性10 s、60℃退火10 s、72℃延伸10 s(共30个循环)。PCR产物经SAP消化(37℃1 h、75℃15 min)后进行单链延伸,延伸体系:SAP消化后模板2μL、ABI SnapShot multiplex Mix 2μL、SNP对应引物1μL;延伸反应条件:98℃10 s、50℃5 s、60℃30 s(25个循环)。经测序仪(Applied Biosystems,3730XL)检测后通过峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知渗入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。LMP2和LMP7基因的扩增引物和延伸引物信息见表1。
图表编号 | XD00157378800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.18 |
作者 | 刘楠楠、刘舒媛、王辉、张新文、李传印、史荔、张淑琼 |
绘制单位 | 中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、昆明市第三人民医院、中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、昆明市第三人民医院 |
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