《表1 布雷特菌在NCBI-Genome数据库中的主要生物信息条目及数量》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于NCBI数据库的布雷特菌生物信息分析运用》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

NCBI Genome是包含基因组的组装和注释等信息的全基因组数据库，且和NCBI Taxonomy等数据库互相链接。从NCBI Genome数据库检索可知当前围绕布雷特菌的多项分子生物学研究逐步增多，检索出的布雷特菌的主要生物信息条目及数量详见表1，其中已有6株菌公布了全基因组序列。第一个菌株CBS2499是Woolfit等人于2007年开始研究的，第二个菌株AWRI1499的基因组于2012年发表[4]。数据库中Brettanomyces bruxellensis AWRI1499和Brettanomyces naardenensis两株菌的蛋白质注释研究较为深入，如AWRI1499菌株的基因组大小12.67Mb，GC含量39.9%、已注释了4861个蛋白。通过对布雷特菌基因组分析可知其特征之一是含有丰富的转运蛋白，对氮源和碳源的转运能力较强，这也反映了布雷特菌在营养贫瘠环境中有长期生存的能力[8-9]；一些氧化还原酶的编码基因具有多拷贝，反映了有氧条件下布雷特菌有较强的产酸能力[10]；基因组中含有多个基因簇，反映了布雷特菌协同完成代谢及产生多种风味化合物的能力[11]，这为布雷特菌的酶蛋白分子的定向进化和代谢流改造打下了信息基础。