《表7 本研究测得所用材料的花药芯片数据》

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《栽培稻种间杂种不育基因S1的图位克隆》

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对ORF11和ORF12进行了基因组测序比较，发现这两基因在两亲本间存在较大的差异，并且都导致了的氨基酸的改变，因此不能从基因组水平排除任何一个。根据网上预测的ORF框，设计了引物对（表6），对这2个ORF在两亲本单核晚期花药与子房的混合物RNA进行了几对引物的RT-PCR检测，发现ORF12有特异表达带出现，而ORF11几对引物RT-PCR都未扩增出特异表达条带（图7）。ORF11在网上公开的芯片数据也不被认为有表达，本实验委托博奥公司做的表达芯片结果也表明ORF11在花药不表达（表7）。用ORF12的引物对ORF12-1进行RT-PCR检测IRAT216、IRAT216S1-g1、F1 3个材料的根、茎、叶、花药各组织部位都有表达产物，且表现出组成型表达特征（图8）。ORF12的芯片数据较大且基本是组成型表达（图9）。因此排除ORF11，确定ORF12为唯一的候选基因。