《表2 MaWAT1s及其编码蛋白的基本信息》
通过本地blast从香蕉基因组中筛选获得5条香蕉WAT1基因,染色体定位结果显示它们分别位于1号、3号、6号、7号和10号染色体上(图1),按照它们在染色体上的分布依次命名为MaWAT1-1~MaWAT1-5。它们与拟南芥WAT1基因(At1g75500)的相似度分别为64.5%、66.3%、57.1%、65.9%和55.2%,编码蛋白与拟南芥WAT1相似度分别为71.6%、72.5%、58.4%、73.5%和55.8%。5条MaWAT1s gDNA长度为1 954~2 877 bp,CDS长度为1 086~1 164 bp,预测分别编码包含361~387个氨基酸、相对分子质量39~42 kD、等电点8.61~9.12的碱性疏水蛋白。其中,MaWAT1-2和MaWAT1-3是不稳定蛋白,其余3个是稳定蛋白(表2)。跨膜结构预测结果显示,所有MaWAT1s都含有10个跨膜螺旋。蛋白信号肽预测结果显示,MaWAT1s均不具信号肽,不属于分泌蛋白[26]。亚细胞定位预测结果显示:MaWAT1-1、MaWAT1-2和MaWAT1-4与拟南芥WAT1一样主要定位在液泡和细胞膜上[27],而MaWAT1-3主要定位在细胞质和细胞膜,MaWAT1-5主要定位在细胞膜和叶绿体。
图表编号 | XD00155487400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.10 |
作者 | 刘嘉鹏、屈蒙蒙、孙雪丽、伍俊为、刘范、田娜、程春振 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺学院·园艺植物生物工程研究所 |
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