《表2 等位基因与荧光标记信息》

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《水稻抗褐飞虱基因Bph3荧光分子标记的开发及应用》

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根据水稻品种BP60中抗褐飞虱基因Bph3序列与9个感褐飞虱品种（9311，桂7571，75-1-27，BL122112B，特B，良丰B，IRBB7和IR1552）的等位基因序列差异（图2），设计共显性分子标记MM3T，所需引物序列已列出（表1）。序列分析结果显示抗褐飞虱与感褐飞虱的Bph3等位基因的序列差异为A/G，设计标记引物Allele-A与PCR反应中的荧光引物FAM匹配，而Allele-G能跟荧光引物HEX匹配，因此根据PCR扩增后得到的荧光信号可获得对应的基因型（表2）。根据荧光信号值进行分析，如果扫描得到荧光类型为FAM，基因型则含等位A碱基；如果扫描得到荧光类型为HEX，基因型则含等位G碱基；如果扫描同时得到FAM和HEX两种荧光类型，基因型则含杂合等位A/G碱基。