《表2.MLST等位基因序列信息及多样性》

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《罗伊氏乳杆菌肠道分离株的遗传多样性研究》


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使用BioNumerics v6.6软件划分132株L.reuteri的序列型。132株L.reuteri共划分为63个STs型,表明L.reuteri具有较高的遗传多样性,其中菌株数最多的ST型为ST-1(14株菌),分别来自啮齿类、人类和家禽,占总菌株数10.6%,其次含有菌株数最多的ST型为ST-4(13株菌),其余ST型包含的菌株为2–9,另外尚有42个STs型只包含1株菌,占菌株总数的31.82%。我们发现分离自不同样品的L.reuteri的STs大部分是不同的,其中以啮齿类的多样性最高,共形成26个STs型,每个ST型分别包含1–3株菌;分离自人类的菌株共包含10个STs型,其中分离自人类分离株主要来自ST-1(11株菌,39.29%)和ST-5(8株菌,28.57%);分离自家禽和猪的菌株各包含15和16个STs型,ST-7是家禽分离株的主要序列型,共包含4株菌(15.38%),ST-4是猪分离株的主要序列型,共包含10株菌(25.00%);分离自反刍动物和马的菌株共包含3个STs型,其中ST-45是反刍动物分离株的主要序列型(7株,77.78%)。上述结果显示,不同分离源的菌株有着不同的序列型,但同一分离源的菌株的基因亦存在多样性,表明这些L.reuteri分离株在不同的生存环境下经历了特定的进化历程,即菌株在不同的生存环境下为了适应环境而导致的基因组多样性增加。