《表5 栀子SSR位点分析》

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《栀子环烯醚萜类物质生物合成相关基因的挖掘与分析》

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本研究利用MISA软件在栀子转录组的所有Unigene中共发现50 571个SSR位点，有5 671条Unigene存在混合型重复单元（表5）。可见，本研究构建的栀子转录组SSR种类丰富，均存在不同的重复类型，同时不同类型出现的频率也存在较大差异。以二、三核苷酸重复所占比例较高，分别占21.38%和15.16%；五、六核苷酸重复所占比例低，分别占0.40%和0.35%。在栀子所有被检出的SSR中，有100种重复基元出现，出现频率最高的3类基序为：AG/CT（6 391），C/G（2 441），AC/GT（2 384）。在三核苷酸重复基元中，AAG/CTT和AGG/CCT出现最多，分别为2 037个和1 532个。上述结果将为进一步筛选和开发栀子SSR标记、构建栀子遗传连锁图谱构建、辅助育种等研究提供基础数据。