《表4 不同工具在不同条件下的优先权》

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《长非编码RNA鉴定方法研究》


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由于不同物种lncRNA、不同测序数据之间存在一定的差异性,不同的lncRNA鉴定工具设计上存在一定的针对性。CPAT和CPPred为小鼠转录本的鉴定提供了专门的模型。在分析其他物种时,CPAT还提供了果蝇和斑马鱼的模型;CNCI和PLEK可以预测脊椎动物和植物的序列;CPC2还可以预测果蝇、斑马鱼、拟南芥、蠕虫;CPPred提供了适用于斑马鱼、果蝇、酿酒酵母、线虫和拟南芥的模型。不同工具在不同条件下的适用性见表4。