《表1 4种对比方法在第一类模拟数据设置下的统计效力》

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《基于XGBoost的质量性状基因互作检测方法》

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第一类模拟情况下各方法的统计效力值见表1。图3是表1数据的盒图。图4为4种方法在不同模型下的平均效力比较。表1中，粗体为每个模型下最优的方法效力值，值越大表明方法检测性能越好。由图4可知，geXGB具有最优的平均性能，在多数模型下都大幅超越其它对比方法。AGGr EGATOr在MAF=0.2且遗传率大于0.05的情况下可以达到与geXGB几乎相同的性能。但在更小的遗传率情况下，geXGB表现出更好的检测性能。当遗传率为0.01，MAF=0.2时，在6个模型上排位第一，在3个模型上排位第一；而相同遗传率情况下，当MAF=0.4时，geXGB与AGGr EGATOr排位第一的模型个数比为9:2。当MAF=0.4时，AGGr EGATOr在各模型下的平均效力要高于KCCU。但在某些模型下，当AGGr EGATOr效果不好时，统计效力甚至比KCCU还要低。从图3可以看出，相较于geXGB，AGGr EGATOr方法在各模型上的效力浮动各大，而geXGB则更为稳定。