《表3 数据库检索参数:酸化茶园茶树根际土壤微生物蛋白质代谢图谱构建》
使用国际通用的蛋白质组学分析软件Proteome Discoverer2.1对DDA采集的数据进行蛋白质鉴定分析,鉴定结果作为DIA定量数据库,检索数据库采用uniprot网站下载的Fungus和Bacteria数据库(Fungus为Swissprot与Trembl全库,Bacteria为Swissprot库,数据库中加入了11条人工合成多肽的氨基酸序列信息),搜库引擎使用Sequest HT,同时为了去除假阳性结果,数据检索采用正反库检索策略,检索结果在多肽层次以及蛋白层次均采用了FDR≤1%的筛选条件.数据库检索参数如表3.
图表编号 | XD00149444300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.20 |
作者 | 王海斌、王裕华、张奇、林舜贤、张清旭、叶江华、丁力、林生、何海斌 |
绘制单位 | 龙岩学院生命科学学院、福建农林大学生命科学学院、农业生态研究所福建省农业生态过程与安全监控重点实验室(福建农林大学)、龙岩学院生命科学学院、福建农林大学生命科学学院、农业生态研究所福建省农业生态过程与安全监控重点实验室(福建农林大学)、武夷学院茶与食品学院、龙岩学院生命科学学院、福建农林大学生命科学学院、农业生态研究所福建省农业生态过程与安全监控重点实验室(福建农林大学)、龙岩学院生命科学学院、福建农林大学生命科学学院、农业生态研究所福建省农业生态过程与安全监控重点实验室(福建农林大学)、福建农林大学生命 |
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