《表3 数据库检索参数:酸化茶园茶树根际土壤微生物蛋白质代谢图谱构建》

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《酸化茶园茶树根际土壤微生物蛋白质代谢图谱构建》


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使用国际通用的蛋白质组学分析软件Proteome Discoverer2.1对DDA采集的数据进行蛋白质鉴定分析,鉴定结果作为DIA定量数据库,检索数据库采用uniprot网站下载的Fungus和Bacteria数据库(Fungus为Swissprot与Trembl全库,Bacteria为Swissprot库,数据库中加入了11条人工合成多肽的氨基酸序列信息),搜库引擎使用Sequest HT,同时为了去除假阳性结果,数据检索采用正反库检索策略,检索结果在多肽层次以及蛋白层次均采用了FDR≤1%的筛选条件.数据库检索参数如表3.