《表1 PMA-q PCR、q PCR对E.a死活菌混合样品的检测结果比较》
对不同比例的死菌体、活菌体混合液进行PMA-q PCR检测,同时采用常规的q PCR对照,验证该体系对死活菌混合样品的选择性扩增。结果显示(表1),当样品全部为死菌体时(活菌体比例为0%),不加PMA的常规q PCR的Ct值为21,而PMA-q PCR的Ct值为30.22,差异极显著(p<0.01)。当样品中活菌体的比例为10%~100%时,随着活菌体比例的增加,PMA-q PCR的Ct值逐渐减小,而常规q PCR不能区分死、活菌是否均能扩增,Ct值无明显变化,q PCR样品检测的Ct值均小于PMA-q PCR。当活菌体比例为10%~100%(浓度为6.0×107~6.0×108CFU·m L-1),PMA-q PCR所测得的活菌数与理论活菌数值均在同一个数量级,二者无显著性差异,具有良好的线性关系(图6)。结果表明,对于死菌体和活菌体液同时存在的混合液,采用PMA-q PCR检测,能完全抑制混合液中死菌体DNA的扩增,而对活菌体DNA的扩增无影响,仅以活菌体DNA为靶标进行选择性扩增,可以客观地反映样品中的活菌数,从而消除常规q PCR检测中由于死菌体扩增造成的的假阳性。
图表编号 | XD00147397200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.10 |
作者 | 袁英哲、韩剑、王岩、罗明、包慧芳、张春竹、黄伟 |
绘制单位 | 新疆农业大学农学院、新疆农业大学农学院、新疆维吾尔自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室、新疆林业科学院现代林业研究所、新疆农业大学农学院、新疆维吾尔自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所、新疆巴州农业科学研究院、新疆巴州农业科学研究院 |
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