《表2 部分mi RNAs靶位点生物信息学分析》

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《桑树PHR家族基因的鉴定及生物信息学分析》

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利用psRNATarget在线软件对桑树PHR基因的调控miRNA进行预测分析，预测到33个miRNA与PHR基因的调控组合，发现24个桑树miRNA可调控10个PHR基因。较低的期望值表示miRNA与靶基因序列匹配较好，非配对能（unpaired energy，UPE）为解开靶基因m RNA靶位点二级结构所需的能量，较低的UPE值表示miRNA结合或裂解靶基因的可能性较高。本研究展示了期望值小于或等于4.5的部分预测结果（表2）。MnPHR1能同时被miR397a、miR5021、miR854a所识别，可能受这3种miRNA的调控，MnPHR12可能受miR5293的转录抑制调控，MnPHR9可能受miR168a-3p的序列裂解调控，MnPHR2可能受miR2670f的转录抑制调控，MnPHR3可能受miR477c的序列裂解调控，MnPHR6可能受miR530的序列裂解调控，MnPHR8可能受miR827的序列裂解调控。本研究中，不同互作组合的调控方式不同，大约2/3的调控方式属于序列裂解，1/3属于转录抑制（表2）。