《表3 Unigenes的eggNOG分类》

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《基于RNA-Seq技术的乒乓菊转录组分析》


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2个乒乓菊品种的64 601条Unigenes中仅有7 186条注释到eggNOG数据库的24个功能分类(表3)。注释到COG数据库排名前5的组依次是:翻译,核糖体结构域生物合成(598条),翻译后修饰,蛋白质折叠,分子伴侣(425条),整体功能预测(401条),碳水化合物运输与代谢(265条),信号转导机制(261条)。除了功能未知(1 564条)以外,注释到NOG数据库排名前5的组依次是:整体功能预测(597条)、胞内运输,分泌与囊泡运输(269条)、翻译后修饰,蛋白质折叠,分子伴侣(259条)、信号转导机制(144条)和碳水化合物运输与代谢(124条)。