《表1 用于本试验的SRAP引物组合扩增情况》
注:TNB:总条带数;NBP:多态性条带数;PPB:多态性条带比率;Na:观测等位基因数;Ne:有效等位基因数;H:Nei's基因多样度;I:Shannon信息指数;PIC:多态性信息量
以4份果型不同的草果(长型,圆形,椭圆形和梭型)为材料,从153对SRAP引物组合中筛选出12对条带清晰并且多态性好的引物用于草果遗传多样性分析(表1;图1)。12对引物在4个居群48个样本中共扩增出181个条带,其中180个条带具有多态性,所有引物组合的平均多态位点比率为99.45%。每对引物扩增的条带数为10~23条,平均为15.08条,其中me1-em1组合扩增的条带数最多,为23条。除me5-em6组合外,其余11对引物扩增的条带的PPB均为100%。POPGENE软件分析显示12对引物有效等位基因数(Ne)从1.216到1.576,平均值为1.373;Nei's基因多样度(H)从0.155到0.334,平均值为0.233;Shannon信息指数(I)为0.267~0.499,平均值为0.366,3项指标均以me5-em4组合最高,me4-em5组合最低。多态性信息量(PIC值)能反映各SRAP标记在草果遗传多样性分析的效率,本研究中所有标记的平均PIC值为0.276。me5-em4组合的PIC值最高,为0.347,其次是me7-em2,为0.338;引物me4-em5组合的PIC值最低,为0.180。PIC值比较结果与与POPGENE软件分析一致,均表明me5-em4是草果遗传多样性研究中最有价值的引物组合(表1)。
图表编号 | XD00146670200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.08.28 |
作者 | 马孟莉、张婷婷、朱玉逍、齐国芳、雷程亮、王田涛、卢丙越 |
绘制单位 | 红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室、红河学院生命科学与技术学院云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |