《表1 用于本试验的SRAP引物组合扩增情况》

《表1 用于本试验的SRAP引物组合扩增情况》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《利用SRAP标记分析草果遗传多样性》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
注:TNB:总条带数;NBP:多态性条带数;PPB:多态性条带比率;Na:观测等位基因数;Ne:有效等位基因数;H:Nei's基因多样度;I:Shannon信息指数;PIC:多态性信息量

以4份果型不同的草果(长型,圆形,椭圆形和梭型)为材料,从153对SRAP引物组合中筛选出12对条带清晰并且多态性好的引物用于草果遗传多样性分析(表1;图1)。12对引物在4个居群48个样本中共扩增出181个条带,其中180个条带具有多态性,所有引物组合的平均多态位点比率为99.45%。每对引物扩增的条带数为10~23条,平均为15.08条,其中me1-em1组合扩增的条带数最多,为23条。除me5-em6组合外,其余11对引物扩增的条带的PPB均为100%。POPGENE软件分析显示12对引物有效等位基因数(Ne)从1.216到1.576,平均值为1.373;Nei's基因多样度(H)从0.155到0.334,平均值为0.233;Shannon信息指数(I)为0.267~0.499,平均值为0.366,3项指标均以me5-em4组合最高,me4-em5组合最低。多态性信息量(PIC值)能反映各SRAP标记在草果遗传多样性分析的效率,本研究中所有标记的平均PIC值为0.276。me5-em4组合的PIC值最高,为0.347,其次是me7-em2,为0.338;引物me4-em5组合的PIC值最低,为0.180。PIC值比较结果与与POPGENE软件分析一致,均表明me5-em4是草果遗传多样性研究中最有价值的引物组合(表1)。