《表2 获得的16S r DNA序列》

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《济南冬季泉水水系中趋磁细菌的多样性》

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注:所有序列均已提交NCBI数据库。

利用本实验室已经建立的磁分离方法富集济南不同泉水样品中的趋磁细菌，结果发现大明湖的泥样中都存在趋磁细菌，并且趋磁细菌种类多样；而泉眼处（珍珠泉、五龙潭、黑虎泉）及多数河道（珍珠泉、五龙潭）未分离到趋磁细菌，仅黑虎泉下游护城河河道表层泥样存在少量趋磁细菌。利用磁分离富集获得样品进入基因测序及系统发育树分析，共获得7条趋磁细菌序列，其中五条分布在暂定η-变形菌纲（Candidatus Etaproteobacteria）中，两条分布在硝化螺菌门中（图1）。这7个OTU的序列均已提交到NCBI数据库中，序列号如表2所示。其中OTU1为未发表过的全新序列，代表了暂定η-变形菌纲（Candidatus Etaproteobacteria）的一个新的种（MT140292）。其余序列均有类似的序列已经被发表，克隆OTU2与克隆TB24的16S r DNA序列相似度为98%[14]；克隆OTU3、OTU4与已发表克隆OTU29的16S r D-NA序列相似度分别为99%、98%，OTU3和OTU4相似度为98%[15]，可能来自同一的菌株；克隆OTU6与克隆MY3-11A的16S r DNA序列相似度为99%[16]；克隆OTU7与已鉴定趋磁细菌菌株MYR-1相似度为99%[17]。其中OTU1为优势菌株，在大明湖和黑虎泉下游护城河中都有广泛分布，其余菌株只在大明湖泥样中有分布。