《表1 辣椒健康植株和患病植株根际土壤细菌α多样性指数》

《表1 辣椒健康植株和患病植株根际土壤细菌α多样性指数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《辣椒健康植株与患枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性的比较研究》


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注:*:差异显著;**:差异极显著。

经测序分析获得2个样品根际土壤细菌的基因序列为101 975条,QC过滤掉低质量序列后,有效序列的总数为95 598条,有效率为93.75%;经过筛选后的优质序列数为75 854条,其中,患病植株的根际土壤细菌的优质序列比健康植株根际减少14 376条。图1所示,当测序数量>10 000时,随着测序数量的增加,Shannon指数稀释曲线趋于平缓,说明测序数据量合理,可用于描述整个细菌的群落结构。Alpha多样性分析表明(表1),健康植株根际土壤的细菌群落多样性高于患病植株根际土壤。原始数据经质控后按97%的序列相似性可划分为8 302个OTUs(图2)。其中,健康植株根际细菌检测到7 164个OTUs,患病植株根际细菌检测到5 925个OTUs,比健康植株根际减少了1 239个。健康植株根际和患病植株根际土壤细菌特有OTUs所占比例各有差异,其中,健康植株根际细菌特有的OTUs占其总数的33.17%,患病植株根际细菌特有的OTUs数目占其总数的19.21%。说明患病植株根际细菌群落与健康植株根际细菌群落在OTUs水平上存在明显差异。