《表3 健康辣椒和患病辣椒根际土壤细菌在不同分类阶元的细菌丰度》

《表3 健康辣椒和患病辣椒根际土壤细菌在不同分类阶元的细菌丰度》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《辣椒健康植株与患枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性的比较研究》


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采用Naive Bayesian assignment算法对健康植株和患病植株根际土壤细菌进行种系分类,测得的细菌群落所有序列可被注释到30个门、61个纲、79个目、179个科和516个属(表2)。在门的水平下,健康植株根际和患病植株根际占优势地位的门均为变形菌门Proteobacteria、酸杆菌门Acidobacteria、放线菌门Actinobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes,但在相对丰度上表现一定的差异,其中Proteobacteria的相对丰度分别为49.86%和52.25%,Acidobacteria的相对丰度分别为14.17%和12.5%,Actinobacteria的相对丰度分别为7.39%和7.76%,Bacteroidetes的相对丰度分别为5.04%和6.95%。同一优势菌门Proteobacteria下,健康植株和患病植株的优势菌纲有所不同,健康植株根际土壤细菌最优势菌纲为α-变形菌纲Alphaproteobacteria,其相对丰度为28.66%,比患病植株增加了10.08百分点;而患病植株根际土壤细菌最优势纲为γ-变形菌纲Gammaproteobacteria,其相对丰度为29.04%,比健康植株增加了13.71百分点。属分类水平上,健康植株根际土壤优势菌属分别是鞘氨醇单孢菌属Sphingomonas、芽单孢菌属Gemmatimonas和产黄杆菌属Rhodanobacter;而患病植株根际土壤优势菌属分别是金属细菌属Metallibacterium、产黄杆菌属Rhodanobacter和鞘氨醇单孢菌属Sphingomonas;辣椒植株患枯萎病后,根际土壤中Sphingomonas和Gemmatimonas丰度分别减少了5.05百分点和2.2百分点,而Metallibacterium和Rhodanobacter丰度分别增加了6.09百分点和3.56百分点(表3)。