《表S2在竞争吸附过程中GO与苯酚、α-萘酚、4-辛基酚分子在不同时刻的相互作用能量》

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《氧化石墨烯吸附水体中酚类有机污染物的分子动力学模拟》

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苯酚、α-萘酚和4-辛基酚分子与GO的吸附能通过一系列伞形采样模拟来计算平均力势（Potential of Mean Force，PMF）而得到。从NPT模拟轨迹中吸附的平衡阶段挑选出一个单分子稳定吸附结构，首先将该吸附结构中的GO固定，沿垂直于GO平面方向以0.01 nm?ps–1的牵引速率将吸附在GO表面上的单个苯酚、α-萘酚和4-辛基酚分子分别拉动到质心距离为3 nm左右的位置，然后从牵引轨迹中每隔0.1 nm的间距取一个采样窗口。对于每个选择的采样窗口，以弹性系数为1000 kJ?mol–1?nm–2的简谐力将酚类有机分子限制在选定的窗口中，在NPT系综下进行200 ps的平衡模拟，再续跑10 ns用于数据分析。伞形采样模拟的其他计算细节与MD模拟中使用的参数相同。最后，采用加权直方图分析方法（Weighted Histogram Analysis Method，WHAM）[6]得到PMF并计算吸附能。