《表4 乙醇胁迫下差异显著基因》

《表4 乙醇胁迫下差异显著基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《副干酪乳杆菌SMN-LBK在乙醇胁迫下的转录组分析》


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注:表中为部分差异显著基因,其余基因均为假设蛋白,没有功能分析,因此未在表内列出。

GO富集分析以阈值(P<0.05)为依据评价差异基因的主要生物学功能,其主要包括细胞组分(cellcular component,CC)、分子功能(molecular function,MF)和生物过程(biological process,BP)三类。由图6可知,SP10与S10相比,BP组蛋白代谢过程、细胞内蛋白代谢过程、翻译过程为显著富集GO term;CC组核糖体、核糖核蛋白复合物为显著富集GO term;MF组核糖体的结构成分、金属离子跨膜转运蛋白活性为显著富集GO term。KEGG是一个综合数据库,整合了基因组信息、化学信息和生化系统功能信息。KEGG Orthology(KO)是KEGG直系同源数据库,将各个KEGG注释系统联系在一起,将分子网络和基因组信息联系起来,根据直系同源关系,实现跨物种的基因组或转录组的功能注释。结合KEGG数据库对差异显著基因参与的相关代谢通路进行了分析,由表4可知,差异显著基因主要参与了丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、脂肪酸生物合成、ATP结合盒式蛋白(ATP-bindingcassette,ABC)转运体、磷酸转移酶系统(phosphotransferase system,PTS)。