《表4 甘枣宁治疗NAFLD的生物学过程和通路富集分析》
73个甘枣宁—NAFLD交集基因影响多个生物学过程,包括应对营养物质水平、应对脂多糖,细胞应对有机氮化合物、应对无机物、活性氧代谢等生物过程。具体见表3。2.4交集基因的PPI分析对于73个交集基因的基因列表,利用BioGrid6[10]、InWeb_IM7、OmniPath8[11]数据库进行PPI富集分析。生成的网络包含与列表中至少一个其他成员形成物理交互的蛋白质子集。分子复杂检测(MCODE)算法[12]已被用于识别密集连接的网络组件。已经收集了为单个基因列表识别的MCODE网络,如图6所示。PPI互作P值最显著的3个生物学过程:糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、IL-4-IL-13信号通路、液体剪切应力和动脉粥样硬化通路。将pathway和process enrichment analysis分别应用于每个MCODE组件,并保留了3个P值得分最高的术语作为对应组件的功能描述,见表4。甘枣宁治疗NAFLD的核心基因及所属MCODE子集信息见表5。
图表编号 | XD00137363600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 余钦、赵沙沙、王婉先、姚曼、郑国银、翟笑枫、凌昌全 |
绘制单位 | 上海中医药大学研究生院、上海中医药大学研究生院、上海中医药大学研究生院、海军军医大学附属长海医院中医肿瘤科、海军军医大学附属长海医院中医肿瘤科、海军军医大学附属长海医院中医肿瘤科、海军军医大学附属长海医院中医肿瘤科、海军军医大学中医系 |
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