《表6 水杉lncRNAs的长度及数量》
因为只有在PLEK、CNCI和CPC三个软件同时预测到的lncRNAs的基础上,进一步用Pfam软件作预测得到的lncRNAs才为真正的lncRNAs(相当于四个不同软件同时作预测,均表现为lncRNAs的基因转录本为最后确定的lncRNAs)。因此,在前三个软件预测结果的lncRNAs中,我们进一步用Pfam软件作了筛选(表6)。总共发现3 385个lncRNAs,长度介于200~11 134 nt,平均长度为1 956 nt。大部分lncRNAs的长度介于200~2 000 nt(59.5%),在2 001~4 000 nt的长度范围内;也发现有较多的lncRNAs,占到总数的32.2%;但在4 001~6 000 nt的长度范围内,只有7.6%的lncRNAs;长度超过6 000 nt的lncRNAs很少,总共仅有25个(占总量的0.7%)。
图表编号 | XD00131460300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.14 |
作者 | 刘小红 |
绘制单位 | 西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、西华师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |