《表1 抑病土壤中与病害抑制有关的微生物物种汇总表》

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《植物病害防治相关微生物组研究进展与展望》

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多名研究者基于微生物组学方法对抑病土和非抑病土之间的微生物种群差异进行了调查。在农业实践过程中发现一些土壤能够专一性地抑制特定的植物病原菌，包括常见的镰刀菌属，立枯丝核菌属和根串珠霉属等病原微生物。通过微生物组分析发现多种与抑制病原菌有关的微生物种群[24～35]。Mendes等[24]使用系统发育芯片（PhyloChip）研究了甜菜根际土壤中微生物组，从而在抑病土中定位出多种抑制病原菌立枯丝核菌的微生物。物种分类注释后，发现假单胞菌科（Pseudomonadaceae），伯克氏菌科（Burkholderiaceae），黄色单胞菌目（Xanthomonadales）和乳杆菌科（Lactobacillaceae）是与抑制病害有关的细菌菌群。进一步使用纯培养方法发现，γ-变形菌门表现出非核糖体多肽合成酶活性，这些活性物质对抑制病害真菌有着重要作用。Carrio?n等[36]使用宏基因组学方法对甜菜根内微生物组进行了更深入的研究，发现在抑病土中接种立枯丝核菌可以诱导甜菜根内噬几丁质菌科（Chitinophagaceae）和黄杆菌科（Flavobacteriaceae）的富集。此外在功能方面，发现几丁质酶、非核糖体多肽合成酶和酮化合物合成酶的基因合成簇增多，而这些增多的基因合成簇具有抑制病原菌的功能特性。该研究从微生物功能方面揭示了抑病土的抑病机制。另一方面，科研工作者也注意到真菌在抑制病原菌方面同样扮演着重要角色。在一些研究中发现，毛壳菌属，青霉属和木霉属（Trichoderma）等真菌类微生物在抑病土中的丰度高于其他非抑病土，通常这些微生物与抑制病原菌和促进植物健康有关[37～39]。此类真菌有些已经是常用的生防菌种，例如木霉属。植物真菌组学方面的研究进一步丰富了潜在的生物资源库。与其他植物，如大麦、草莓、烟草和黄瓜等的病害相关的抑病土和非抑病土微生物组研究也多有报导（表1）。