《表4 20个SSR位点的遗传变异和杂合性》
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《69份苦玄参种质SSR遗传多样性及品质性状相关标记分析》
注:Na.观察等位基因数;Ne.有效等位基因数;I.Shannon信息指数;Obs_Het.观测杂合度;Exp_Het.预期杂合度;Nei.基因多样性指数;Ave_Het:平均杂合度。与基因位点比较1)P<0.05,2)P<0.01。
20对引物在69份种质中的扩增结果见表3,遗传多样性分析结果见表4。共扩增出76个等位基因,每个位点1~7个,平均每个位点3.8个,有效等位基因1.969 2个,观测等位基因高于有效等位基因,表明等位基因分布不均匀,其中位点P59和P72获得最多的等位基因;位点P60获得的等位基因数最少,呈单态。所有位点中,仅P4位点在一个样品中未扩增出产物,其余均有扩增;其中,平均多态位点52.75个,多态率38.24%,而位点P7,P52,P60在69份种质中均呈纯合状态。从等位基因出现频率来看,稀有等位基因(频率<5%)占38.2%,稀有基因较多。其中频率<1%的占17.11%,将近稀有基因的一半,只出现1次的基因有4个,分别出现在编号zgb09的P21位点,片段大小86 bp;编号xyj03的P59位点,片段大小260 bp;编号hzp02的P69位点,片段大小199 bp;编号zgb05的P93位点,片段大小188 bp。稀有基因多,可为筛选变异位点提供更多机会。各位点多态信息含量(PIC)变化范围为0~0.621 1,平均0.378 0;Shannon多态性信息指数(I)变化范围0~1.240 1,平均0.759,Nei's基因多样性指数(Nei)变化范围0~0.682 3,平均0.440 9,其中最高的为P21,最低为P7;以上3个指标在不同位点间变化范围均较大,说明不同位点的遗传变异具有较大的差异。20个位点中,观测杂合度变化范围0~0.587,平均0.382 4;期望杂合度变化范围0~0.684 8,平均0.442 5,不同位点杂合度存在较大差异。平均观测杂合度低于期望杂合度,说明种群内存在一定程度的近交率,杂合子缺失,纯合性较高。
图表编号 | XD00128361400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 闫国跃、杨帆、白燕远、李耀燕、吴梦丽、高慧、张淼、阿里穆斯、谢阳姣 |
绘制单位 | 中央民族大学民族医药教育部重点实验室药学院、广西中医药大学瑶医药学院、广西壮瑶医药与医养结合人才小高地、广西中医药大学瑶医药学院、广西中医药大学瑶医药学院、广西壮瑶医药与医养结合人才小高地、广西壮瑶药工程技术研究中心、广西中医药大学瑶医药学院、广西壮瑶医药与医养结合人才小高地、广西壮瑶药工程技术研究中心、广西中医药大学瑶医药学院、中央民族大学民族医药教育部重点实验室药学院、广西中医药大学瑶医药学院、广西壮瑶药重点实验室(壮瑶药协同创新中心)、中央民族大学民族医药教育部重点实验室药学院、广西中医药大学瑶医药 |
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