《表1 广西国有东门林场基因库内无性系群体SSR位点遗传变异参数》
注:HO为观察杂合度,HE为预期杂合度;PIC为多态性信息含量,EP1为在候选父本群体中随机取样,被排除为疑似父本的概率;EP2为当母本已知时,在候选父本群体中随机取样,被排除为疑似父本的概率。
以半同胞子代、试验林及周边采集到的共163个基因型DNA样本为模板,筛选得到表1中的11对具有较高多态性的引物:EUCe SSR0037、EUCe SSR0166、EUCe SSR0176、EUCe SSR0224、EUCe SSR0465、EUCe SSR0539、EUCe SSR0592、EUCe SSR0606、EUCe SSR0703、EUCe SSR1001、EUCe SSR1063。上述引物被用于7个半同胞子代的父本鉴定,并通过POPGENE软件对每个多态性位点的等位基因数(NA)、有效等位基因数(NE)、观察杂合度(HO)、预期杂合度(HE)和多态性信息含量(PIC)进行估算,结果显示:在163个基因型中每个位点检测到3至16个等位基因;观察和预期杂合度(HO和HE)分别为0.119至0.748(平均值为0.527)和0.311至0.814(平均值为0.618);多态性信息含量为0.281至0.784(平均值为0.572)。通过Cervus软件计算双亲未知情况下在候选父本群体中随机取样的排除率EP1,和已知母本情况下在候选父本群体中随机取样的排除率EP2,结果显示11对引物对父本的排除率EP2大于99.8%,表明可以有效排除候选父本中的非遗传父本。
图表编号 | XD0051282500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.01 |
作者 | 王建忠、兰俊、陆珍先、杨珺、吕华丽、潘志新、费晓云 |
绘制单位 | 广西国有东门林场、广西国有东门林场、广西国有东门林场、北京林业大学生物科学与技术学院、广西国有东门林场、广西国有东门林场、广西国有东门林场 |
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