《表4 与切花菊耐寒性相关的候选基因列表》

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《切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析》


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注:a表示基于E值<10-5的‘神马’和‘优香’转录组文库中显著相关的SLAF序列。

将显著SNP位点所在SLAF标签序列与菊花‘优香’和‘神马’转录组数据库进行BLASTX比对,挖掘到5个候选基因,其功能注释见表4。在‘优香’转录组库中筛到4个SLAF标签。其中两个与脚芽期叶片耐寒性相关:Marker1039053(48 bp)定位到的候选基因为Unigene35739_All,编码羧基末端加工肽酶3、D1 C–末端处理蛋白酶3、光系统ⅡD1蛋白加工肽酶3;Marker26602(126 bp)定位到的候选基因为CL2978.Contig39_All,编码丝氨酸/苏氨酸–蛋白激酶11–互作蛋白。一个与盛花期叶片耐寒性相关的SLAF标签Marker6606-(58 bp)定位到的候选基因为CL2042.Contig4_All,编码囊泡相关膜蛋白727,与AtVAMP727基因有关。另一个与盛花期舌状花耐寒性相关的SLAF标签Marker7493(185 bp)定位到CL6358.Contig1_All候选基因,编码转座子Ty3-G Gag-Pol多聚蛋白、转座子Ty3-1 TYA-TYB多聚蛋白。