《表2 与茶叶色素积累相关的候选基因》

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《红芽直立茶紫色叶形成机制的转录组分析》

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为了分析不同颜色茶叶中的差异基因，我们首先对所有基因进行定量。然后使用FDR<0.05且|log2FC|>1作为差异基因（DEG）的筛选条件，以绿色叶为对照，在紫色叶中一共有8779个基因是差异表达的，其中有6936个基因上调，1843个基因下调（图1A）。分别从紫色和绿色的叶片中选取表达量最高的50个基因进行基因表达模式分析，从图1B中可以看出，这些基因的表达模式分为两种。紫色叶中的基因与绿色相比，大多数基因的表达量上调。基于标准基因名和同义词在差异基因的功能中进行搜索，分析与植物色素积累有关的三个代谢途径（类黄酮生物合成，花青素生物合成，黄酮和黄酮醇生物合成途径）的差异基因（表2）。