《表4 菌株的ST型及对应的等位基因编号》

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《马乳酒样乳杆菌ZW3多位点序列分型》

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8株马乳酒样乳杆菌和2株开菲尔乳杆菌的rpoA、Hsp60、LeuS、rpsB、glyK、pyrG、fusA基因扩增产物经过双向测序后，由于测序结果中的前后20～50 bp的序列可信度较低，故利用Chromas软件检查峰图，依据测序峰图进行人工校对、剪切，并且对序列中的疑似SNP位点进行确认，经过人工校对，利用DNA-MAN 6.0进行正向、反向序列拼接，得到准确的有效序列。最终用于MLST分析的序列长度分别为:rpoA:319 bp、Hsp 60:517 bp、Leu S:390 bp、rpsB:251bp、glyK:361 bp、pyrG:378 bp、fusA:524 bp。在7个基因位点上，每个基因按照所在参考基因组的位置排列（rpoA-Hsp60-LeuS-rpsB-glyK-pyrG-fus A）等位基因数字，所组成的一个独特的等位基因模式即为一个ST型。最终将10株菌株共分为8个ST型，结果见表4。其中俄罗斯地区样品中分离的马乳酒样乳杆菌shan3、shan4、shan5同属一个ST型，其余菌株各不相同，说明不同分离地区的菌株间ST型大部分是不相同的，具有较高的遗传多样性。