《表1 主要林木GWAS研究综述》

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《全基因组关联分析(GWAS)在林木育种中的应用》

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从表1中可看出，在林木GWAS研究中，大部分（60%）研究所选种质材料为相关林木全分布区采样的无关个体构成的自然群体，只有那些在前期具有育种基础（交配设计）的树种所用的种质材料为半同胞家系或全同胞家系。这是由于林木育种进展相对缓慢造成的普遍现象。但自然群体进化历史的各种变异和重组，使数量性状基因座（quantitative trait locus，QTL）的定位精度有明显的提升，对GWAS研究更加有利。也有研究指出，自然群体在做GWAS时容易出现假阳性的结果（Korte和Farlow2013）。但随着DNA测序技术的不断发展，高通量基因分型技术的进一步提高，以及群体结构统计方法的不断更新，促使自然群体在GWAS研究中的重要性逐步显现。从表1可以看出，研究中所用样本大小从100个到3 373个，样本大小不尽相同。在样本大小选取方面，并没有一定之规，关键在于所取样本是否能够代表研究对象的绝大部分基因型，这就要求样本选取的地理范围要含括研究对象的全分布区（Korte和Farlow 2013）。在早期林木育种中，由于育种工作者主要关注林木的产量，通常考虑的目标性状为树高、胸径、材积等生长性状。随着育种工作逐步深入，育种工作者发现林木的木材性状和抗逆性状与生长性状同样重要。由表1可以看出，目前关于林木育种的GWAS研究中，仍然以生长性状（60%）、木材性状（46.7%）和抗逆性状（26.7%）为主，少数有特殊需求的研究主要为生理生态性状或物候性状。