《表4 H32-10vsH32-12和E1-10vsE1-12光合作用相关的高差异表达基因表达》

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《桑树光合作用转录组研究》

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对H32-10vsH32-12和E1-10vsE1-12、H32-10vsE1-10和H32-12vsE1-12GO数据库功能注释的1 092个和2 264个DEGs进行分析，在FC≥2且FDR<0.01的高差异表达基因中筛选功能描述与光合作用相关的基因共10个。其中H32-10vsH32-12和E1-10vsE1-12、H32-10vsE1-10和H32-12vsE1-12中均包括3个下调基因和2个上调基因。10个DEGs在KOG class和Swiss Prot annotation的功能描述统计见表4、表5。从表4可以看出，H32-10vsH32-12和E1-10vsE1-12中的5个DEGs，KOG class为碳水化合物的运输和代谢、防御机制、代谢产物的生物合成、运输和分解代谢的3个基因表达下调，而Swiss Prot注释为Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase，chloroplastic（Precursor）和Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase，chloroplastic(Precursor）表达上调；从表5可以看出H32-10vsE1-10和H32-12vsE1-12中，Swiss Prot annotation注释为Probable GTP diphosphokinase RSH3，chloroplastic(Precursor）GN=RSH3和Translocase of chloroplast 34，chloroplastic GN=MUG13.14以及Cytochrome P450 71A2 GN=CYP71A2的表达下调，而注释为Cytochrome P45071A1 GN=CYP71A1和Cytochrome P450 71D10GN=CYP71D10的2个DEGs则表达上调。推测上述10个基因是造成同一品种不同时段、同一时段不同品种间净光合速率差异的原因。